近期，山西省晋城市税务部门在企业所得税汇算清缴后续管理中，发现某制造业企业连续3年申报享受研发费用加计扣除金额较大。经逐项核查企业研发留存资料，税务干部确认该企业部分人工费用、直接投入费用不符合研发费用加计扣除的条件。经依法纳税调整后，该企业补缴税款及滞纳金共0.51亿元。

研发费用加计扣除政策是国家鼓励企业科技创新的一项重要税收优惠政策，在推动企业发展、产业升级等方面发挥着重要作用。然而在政策落实中，常常出现研发费用加计扣除形式不符合要求、项目定性混淆、金额归集不准等风险。国家税务总局晋城市税务局通过数据驱动筛查风险、市县联动强化履职、部门互动优化辅导，全方位提升研发费用加计扣除政策合规管理水平，引导企业精准、规范享受政策。今年以来，全市税务部门共对13家企业开展研发费用加计扣除政策合规核查，入库税款及滞纳金0.78亿元。

数据驱动筛查 靶向锁定涉税风险

为提升风险识别精准度，破解研发活动判定难、风险排查不准等痛点，晋城市税务局持续夯实干部专业能力，特邀科技部门业务骨干开展6次专题授课，清晰界定科技活动与研发创新活动的判定标准，统一政策识别口径。同时，聚焦煤炭开采、煤机生产、软件开发、工程建筑等本地重点行业，深入钻研行业生产模式、专业技术特点及领域前沿动态，全面提升本局干部风险研判专业水平。

据了解，晋城市税务局系统梳理全市近3年来研发费用加计扣除申报数据，针对申报户数、扣除金额增速较快的态势，精准研判潜在的政策适用风险。该局依托大数据分析手段，结合企业行业属性、营收变动、加计扣除金额增幅、各项费用占比、特殊收入冲减费用等核心指标，搭建专业化风险数据分析模型，对76家企业开展全覆盖风险筛查，重点锁定加计扣除金额同比增长20%以上的27家煤炭企业、8家大型企业作为核查对象，进行风险“画像”，有针对性地实施监管。

市县统筹发力 筑牢基层征管根基

针对以往基层风险应对中存在的任务难度大、专业力量弱、工作指引不足等短板，2025年以来，晋城市税务局强化市县两级联动协同，健全工作机制、细化工作标准，全面提升基层风险处置能力。

晋城市税务局编制下发研发费用加计扣除合规管理专项工作手册，动态更新典型涉税案例，为基层一线提供标准化、实操性强的工作指引。同时，组织开展4期专题合规培训，围绕研发项目创新点判定、研发实施路径核查、研发人员资质核验、研发台账管理、特殊收入抵扣等关键环节细化核查要点，指导基层干部精准甄别不合规情形，全面提升税源管控能力和风险应对质效。

在此基础上，该局建立分级分类核查管理机制，实现权责清晰、层层落实。晋城市税务局重点负责单一项目加计扣除金额1000万元以上研发项目的定性研判，统筹开展重点税源企业专项核查；各县区局聚焦千万元级以上项目，做好费用归集、资料核验等精细化核查工作。

据了解，2025年以来，全市税务部门累计对56家企业开展研发费用加计扣除合规核查，通过规范退税管理、追缴税款，减少退税和增加税款共计2.31亿元，合规管理成效显著。

税科联动辅导 强化企业合规意识

为破解企业研发项目定性认知偏差问题，晋城市税务局深化税科联动机制，联合市科技部门开展相关政策辅导，以柔性服务化解涉税风险，引导企业诚信纳税。

此前，晋城市税务部门在对辖区一户大型制造企业开展合规辅导时，发现企业申报的“手机移动端报修管理系统”项目存在政策适用疑点。企业财务及研发人员认为项目为自主开发，属于研发创新活动，可享受加计扣除优惠。税务部门核查发现，该项目主要依托行业成熟编程技术进行本地化适配优化，无实质性技术创新突破，且仅留存项目立项书，缺少完整的研发过程台账、实验记录等备查资料，不符合研发费用加计扣除政策享受条件。

针对企业认知偏差，晋城市税务部门主动对接市科技部门，联合深入企业开展现场辅导。晋城市科技局高新技术科依据政策明确，税务机关对企业研发项目存疑的，可提请科技部门专业鉴定；无完整研发过程佐证资料、无法证实实质性创新活动的项目，不得适用加计扣除政策。通过税务、科技两部门梯次核查、精准释法，企业最终认可核查结论，主动调减不合规研发加计扣除金额507.34万元。

2025年，全市共有8家企业针对73个研发项目提出政策异议，经税科联动专业审核、精准辅导后，企业均认同合规整改意见，累计入库税款4726万元，有效纠正了政策错享问题。

下一步，晋城市税务局将持续坚持“监管+服务”并举，把合规管理融入纳税服务全过程，不断优化研发费用加计扣除管理机制，常态化开展政策辅导，引导企业准确理解政策、规范运用政策，助力企业持续深耕创新领域，实现合规稳健发展。