本案是一宗典型的关联企业股权交易核定案。涉案企业以低价将其所投资银行的股权转让给关联企业，并且未就该项交易进行纳税申报。交易双方自认为稳妥周全，但在检查人员缜密细致的调查下还是露出了破绽。

本案的顺利查结，有赖于检查人员对关联交易的准确辨识，以及在价格核定时善用“外力”，最终准确核定股权交易成本、合理评估交易价格。

在案件调查取证过程中，准确、公允地核定交易股权的成交价格，确定涉案企业的实际持股成本，是本案的难点所在。为此，检查人员对交易的目标——J银行股权及其股份流通情况进行了审视，并因此发现了常州股权托管中心这一案件调查的关键机构。事实证明，该机构的协查取证，对检查人员确定涉案企业持股实际成本，掌握同期J银行股权转让市场价格起到了关键作用，成为案件调查中的一个突破口，为后续的办案工作奠定了基础。

针对涉案企业对税务机关核定价格提出的异议，在符合税法规定和市场规律的基础上，从维护纳税人合法权益的角度出发，检查人员引入了第三方评估机构对股权交易价格实施评估，最终得出了较为客观、公允的股权评估价格，使企业心服口服地补缴了所欠税款。

本案的查办，为税务机关今后调查非上市企业股权交易涉税案件积累了经验，提供了可供借鉴的样本。