2024年12月，马来西亚税务局发布了修订版《转让定价指南》（以下简称《指南》），为到马来西亚投资企业与国际关联方之间开展关联交易提供了转让定价指导意见。修订版《指南》倾向于在相关信息不可靠的情况下，推荐企业采用交易净利润法进行转让定价。

之所以出现如此修订，是由于以往到马来西亚投资的企业在选择与关联方之间业务往来的定价方法时，往往倾向于使用成本加成法等传统的转让定价方法，由此与马来西亚税务部门产生争议，增加了企业税务合规成本。马来西亚的近海卓越航运私人有限公司（以下简称卓航公司）与马来西亚税务部门就转让定价方法选取产生的法律纠纷，就是一个典型案例。

因转让定价争议被调查补税

卓航公司主要从事海上支援船的租赁业务，该公司与另一家位于纳闽岛的鹰高公司，同属马来西亚近海卓越集团，鹰高公司为卓航公司提供船只租赁服务与船员管理服务。由于纳闽岛为马来西亚的低税区，马来西亚税务部门对与纳闽岛的企业发生的关联交易会进行转让定价的相关审核评估。

2014年—2016年，卓航公司采用了成本加成法确定与鹰高公司关联交易的公平成交价格，并以35%的成本加成率向鹰高公司支付了船只租赁费和船员管理费。

马来西亚在2012年首次发布的《指南》中建议，仅在成本加成法、再销售价格法等传统转让定价方法没有可靠数据可用或在特殊情况下无法应用时，才使用交易净利润法。2017年，马来西亚税务部门对卓航公司与鹰高公司间的关联交易进行了转让定价审计，最终在2021年决定采用交易净利润法对其关联交易进行重新定价，并要求卓航公司缴纳2014年—2016年欠缴的税款和罚款，合计1980余万林吉特（1马来西亚林吉特约合1.69元人民币）。卓航公司随即向马来西亚高等法院申请了司法审查，要求马来西亚税务部门撤销采用交易净利润法重新进行转让定价的决定。

如何选择定价方法成争议焦点

本案争议的焦点是，卓航公司与鹰高公司间关联交易的最佳转让定价方法，应该是成本加成法还是交易净利润法。成本加成法是按成本加上合理利润来对产品或服务定价的方法，合理利润的确定主要靠选取可靠的可比公司毛利率，作为自身关联交易的合理利润率；交易净利润法与成本加成法相似，但主要使用的是净利润率。

卓航公司习惯性采用了成本加成法，认为其选择的可比公司与鹰高公司所从事的活动主要都是船只租赁服务与船员管理服务，在功能上具有可比性。但马来西亚税务部门认为船舶在性能、类型、折旧方法上的差异，以及企业在船舶投资支出、维修费用上的差异等多方面因素都会影响销售收入与营业成本，进而影响企业毛利率。卓航公司也没有提供可比公司财务数据等相关资料来对企业毛利率的可比性进行佐证。

卓航公司认可其对可比公司的选择存在不足，但同时提出，他们通过国际常用的计算方法依旧能够获得可靠的毛利率。因为他们计算了可比公司在2013年—2015年毛利率的加权平均值，并以这些平均值的通用范围作为鹰高公司所提供服务毛利率的参考。

对此，马来西亚税务部门仍然认为，即使企业承担着相似的功能，但在实际生产经营中承担的风险不同，其利润水平也存在差异。尤其是在本案例关联交易中，基于船只所有权的利润仅由鹰高公司部分实现，而卓航公司承担了市场和财务等重大风险，采用35%的成本加成率计算交易价格导致双方之间风险利润分配不平衡。所以，马来西亚税务部门判定卓航公司在转让定价方法的应用上，未充分考虑功能、风险与利润间的分配关系。

出现分歧时，与税务部门加强沟通

2024年8月，马来西亚高等法院驳回了卓航公司的申请，要求所得税特别税务专员根据马来西亚《所得税法》第99条审理该上诉。

具体来看，尽管马来西亚高等法院认同税务部门采用交易净利润法进行重新定价的合理性，但根据相关救济规定，具体定价方法最终仍应由所得税特别税务专员确定。此次，马来西亚修订版《指南》就针对这类情况调整了转让定价方法选择的倾向，提出面对可比公司数据可靠性不足的实际情况，更加倾向于使用交易净利润法。因为在实操过程中，常常会遇到可比公司数据可靠性不足的问题，为了减少未来可能产生的税企争议，采用交易净利润法的情况也比较多。

本案例也提醒到马来西亚投资的企业，在实际选择转让定价方法时，需要考虑是否有足够多的可靠信息来消除与可比公司在交易资产和劳务的特性、功能执行及资产使用、风险承担、合同条款、经济环境、经营策略等方面的差异。依据修订版《指南》，在缺少第三方公司毛利率数据或数据不太可靠的情况下，难以使用成本加成法等传统交易方法。例如，采用不同会计处理方式，导致毛利率存在差异时，交易净利润法可能是更合适的方法。

此外，到马来西亚投资的企业在转让定价方法应用过程中，需同时考虑各方的贡献度及其需要承担的风险两个方面，不能仅依照某一方面的大小就对利润作出分配，或者也可以通过签订预约定价安排来减少后续被当地税务部门调查的风险和税务合规成本。在与当地税务部门磋商的过程中，企业还能加深对东道国法律法规的理解，就模糊条款与税务部门提前沟通。